Transmission de l'influenza aviaire : notre consoeur Claire Guinat reçoit une bourse ERC

Épidémiologie

Notre consoeur Claire Guinat (chargée de recherche à l'Inrae*, groupe Epidémiologie et décision en santé animale de l'unité Interactions hôte-agent pathogène) a reçu une bourse ERC Starting Grant pour son projet TrackFLU (5 ans, 1,5 million d'euros) pour étudier les mécanismes de transmission des virus de l'influenza aviaire dans les marchés de volailles vivantes au Cambodge. «  Via une approche pluridisciplinaire, elle intégrera l'épidémiologie, l'écologie des systèmes d'élevage et l'évolution virale pour analyser les données collectées dans le cadre d'un vaste travail de terrain au Cambodge » , a précisé l'Inrae, le 5 septembre.

Alors qu'en Europe, les volailles suivent un cycle court de la ferme à l'assiette en passant par les abattoirs, en Asie du Sud-Est, elles passent par un réseau complexe : les marchés de volailles vivantes, caractérisés par « une forte densité et un mélange de différentes espèces d'oiseaux avec un niveau de biosécurité limité. Ils constituent une tradition culturelle forte en Asie du Sud-Est. Les consommateurs sélectionnent les oiseaux vivants en accordant une attention particulière à leur apparence et leur santé avant de les faire préparer sur place » , explique l'Inrae.

Les volailles sont transportées entre de multiples marchés par des commerçants avant d'être abattues, soit un écosystème parfait pour le maintien et l'émergence de nouvelles souches du virus.

Une étude de terrain se déroulera les deux premières années du projet au Cambodge.

Collectes de données

L'Inrae indique que des études ont montré les taux les plus élevés de détection du virus de l'influenza aviaire au Cambodge, avec 30 à 50 % des canards et 20 à 40 % des poulets testés positifs, et des niveaux importants de cocirculation de plusieurs souches du virus.

« Nous allons mener les collectes de données pendant les périodes où se déroulent les festivals traditionnels, périodes à haut risque pour la circulation du virus. Nous interrogerons les marchands de volailles et feront des prélèvements d'oiseaux pour découvrir comment le virus se propage dans ce réseau complexe. Nous commencerons par les plus grands marchés et explorerons progressivement l'ensemble du réseau » , explique Claire Guinat.

En décryptant les mécanismes de transmission de l'influenza aviaire, le projet TrackFLU veut informer de manière proactive les principales parties prenantes - autorités locales et services vétérinaires - sur les stratégies optimisées fondées sur des preuves scientifiques pour contrôler le virus dans le pays.

Une application web permettra aux utilisateurs de prédire la transmission du virus dans les réseaux de marchés. V.D.

* Inrae : Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement.